時計遺伝子（とけいいでんし、英 clock gene）は、概日リズム（体内時計）をつかさどる遺伝子群を指す。動物では period (per), Clock (Clk), cryptochrome (cry) などが知られている。時計遺伝子に変異が起こると、モデル生物では恒常条件下（恒常的な暗黒や連続照明）概日リズムが保てず、活動にリズムがなくなったり（無周期）、短い、あるいは長い周期（短周期、長周期）で行動するようになる。
概日時計は遺伝子調節のフィードバックに基づいている(Cell 7章 P460-462)
今年、ある大学の先生の講演会で「時計遺伝子」のことについて知りました。
地球上に生息するほぼすべての生物は,その体内に正確に時間を刻む分子機構を獲得しているそうです。
視交叉上核に時計遺伝子の中枢がありますが,血管や肝臓といった各臓器にも時計遺伝子が存在しているのです.
Period とClock という時計遺伝子が各臓器にあり,BMAL1 という時計遺伝子が制御しています.そのBMAL1 の遺伝子発現が各臓器の日内リズムを決めているのだそうです。
現在、BMAL1 と,血圧変動や動脈硬化の進展の関係を検討されているのだそうです。
さらに、その先生は、「時計遺伝子」だけでなく、まだ証明されていないが、「空間遺伝子」も必ず存在するはずだと言っていらっしゃいました。
そして、病気は、この「時間」と「空間」のひずみによって起こってくるという、まるで宇宙物理学の講義を聴いているようでした。
人体とは、まさに「宇宙」そのものなのだと思いました。